Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PHRF1Q9P1Y6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PHRF1Q9P1Y6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PHRF1Q9P1Y6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms