Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNRD1Q9P1U0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms