Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D2Q9NY47 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNA2D2Q9NY47 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms