Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ING3Q9NXR8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ING3Q9NXR8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms