Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRAK4Q9NWZ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRAK4Q9NWZ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms