Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOMER3Q9NSC5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOMER3Q9NSC5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOMER3Q9NSC5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms