Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GKN1Q9NS71 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GKN1Q9NS71 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms