Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO6Q9NRD1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms