Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCI7

MSL2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL2Q9HCI7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSL2Q9HCI7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms