Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRABDQ9H4I3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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