Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA6AQ9H2E6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms