Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPF3BQ9BZI7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
UPF3BQ9BZI7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UPF3BQ9BZI7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms