Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE3

LCE3D, Late cornified envelope protein 3D, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3DQ9BYE3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LCE3DQ9BYE3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LCE3DQ9BYE3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms