Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF4Q9BXJ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF4Q9BXJ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms