Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTA3Q9BTC8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTA3Q9BTC8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms