Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GINS3Q9BRX5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms