Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MXRA8Q9BRK3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MXRA8Q9BRK3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms