Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TXNDC17Q9BRA2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TXNDC17Q9BRA2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms