Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYT3Q9BQG1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SYT3Q9BQG1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms