Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCAPGQ9BPX3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCAPGQ9BPX3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCAPGQ9BPX3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms