Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NAP1L3Q99457 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAP1L3Q99457 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms