Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF12Q99081 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCF12Q99081 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms