Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUFY1Q96T51 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUFY1Q96T51 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms