Protein–RNA interactions for Protein: Q96SA4

SERINC2, Serine incorporator 2, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2Q96SA4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SERINC2Q96SA4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SERINC2Q96SA4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms