Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRAMP1Q96RY5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CRAMP1Q96RY5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRAMP1Q96RY5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms