Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NLRP3Q96P20 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NLRP3Q96P20 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms