Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLUHP3Q96NS8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms