Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RILPQ96NA2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms