Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC45A3Q96JT2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC45A3Q96JT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms