Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHAMP1Q96JM3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAMP1Q96JM3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAMP1Q96JM3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms