Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSIG2Q96IQ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VSIG2Q96IQ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms