Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RBM17Q96I25 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RBM17Q96I25 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms