Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPNQ96H22 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPNQ96H22 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms