Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC97Q96F63 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC97Q96F63 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC97Q96F63 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms