Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTERF3Q96E29 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTERF3Q96E29 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms