Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGBD4Q96DM1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGBD4Q96DM1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms