Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VTI1AQ96AJ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VTI1AQ96AJ9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms