Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPS3Q969F9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS3Q969F9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS3Q969F9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms