Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNPO1Q92973 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms