Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CTTNBP2Q8WZ74 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms