Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCG3Q8WXD2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms