Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMO7Q8WWI1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMO7Q8WWI1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms