Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF2

UCMA, Unique cartilage matrix-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCMAQ8WVF2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UCMAQ8WVF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCMAQ8WVF2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms