Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NUP35Q8NFH5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUP35Q8NFH5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms