Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHDC9Q8NEP7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHDC9Q8NEP7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms