Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSL3Q8N5Y2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms