Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPM1KQ8N3J5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPM1KQ8N3J5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms