Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMTC2Q8N394 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMTC2Q8N394 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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