Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SVBPQ8N300 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms