Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3BQ8IVW6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms